科技型中小企业与高新技术企业（高企）在认定标准上存在诸多不同，这些差异体现了两者在定位、发展阶段以及政策导向等方面的区别。

从企业规模限制来看，科技型中小企业有着明确的规模界定。它要求企业职工总数不超过 500 人、年销售收入不超过 2 亿元、资产总额不超过 2 亿元。这一标准旨在聚焦于具有创新活力的中小企业群体，这类企业虽然规模相对较小，但在科技创新方面具有较大潜力。与之形成鲜明对比的是，高企认定对企业的职工总数、年销售收入以及资产总额并没有直接的数量限制 ，更注重企业的整体创新实力与持续发展能力，涵盖了不同规模的企业，从中小企业到大型企业，只要符合相关创新指标要求都有机会获得认定。

知识产权要求也有所不同。高企认定对知识产权十分看重，要求企业通过自主研发、受让、受赠、并购等多种方式，获得对其主要产品（服务）在技术上发挥核心支持作用的知识产权的所有权 。这意味着企业不仅要有知识产权，而且这些知识产权必须紧密关联到企业核心产品（服务）的技术层面，成为企业在市场竞争中的关键技术支撑。科技型中小企业对于知识产权的要求相对更为灵活。虽然拥有知识产权能为企业加分，但并非是绝对的硬性门槛。企业即便知识产权数量有限，若在科技人员、研发投入等其他评价指标上表现出色，仍有很大机会通过认定。比如一些处于研发初期的企业，可能尚未取得专利授权，但在技术研发上投入巨大，拥有专业的研发团队，也能满足科技型中小企业的认定条件。

在研发投入比例方面，两者差异明显。高企认定对研发投入比例要求严格，企业近三个会计年度（实际经营期不满三年的按实际经营时间计算）的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比例，依企业销售收入规模不同而有别：最近一年销售收入小于 5000 万元（含）的企业，比例不低于 5%；5000 万元至 2 亿元（含）的企业，比例不低于 4%；2 亿元以上的企业，比例不低于 3% 。并且，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于 60% 。如此高比例的研发投入要求，充分体现了高企对于持续创新能力的重视，鼓励企业不断加大在技术研发方面的投入，提升核心竞争力。科技型中小企业的研发投入比例要求相对没有这么细致和严格。它主要通过综合评价指标体系来考量企业的研发投入情况，虽然也看重研发投入，但不会单纯依据销售收入规模来设定固定比例，而是将研发投入与科技人员、科技成果等指标综合起来进行打分，只要企业的综合评价所得分值不低于 60 分，且科技人员指标得分不得为 0 分，就有可能符合认定标准 。这对于一些处于发展初期，销售收入规模较小但研发投入意愿强烈的企业来说，提供了更为宽松的认定环境。

高新技术产品（服务）收入占比要求同样不同。高企认定明确规定，近一年高新技术产品（服务）收入占企业同期总收入的比例不低于 60% ，这凸显了高企以高新技术产品（服务）为核心的业务结构特点，强调企业的收入主要来源于高新技术领域相关产品（服务）的销售。科技型中小企业则没有对高新技术产品（服务）收入占比的明确要求，只要企业提供的产品和服务含有科技元素，具有创新性，即可满足认定条件之一 。这反映出科技型中小企业的业务范畴更为宽泛，不一定完全依赖高新技术产品（服务）来获取主要收入，在技术应用与产品创新方面具有更多样化的发展模式。