高企申报中的常见难点主要包括以下几个方面：

1. ‌自主知识产权数量和质量不足‌：在高企认定中，知识产权的数量和质量都是重要的评估因素。如果企业仅有一两项发明专利，可能不足以获得评审专家的认可。因此，企业需要提前做好知识产权规划，通过转让或申请的方式尽快取得与企业主要产品在技术上发挥核心支持作用的相关知识产权。
2. ‌研发费用归集困难和占比不足‌：研发费用的归集范围较广，包括研发人员工资、社保、材料费、知识产权申请费、试制费、外包开发费用等。企业在申报时如果没有做好相关规划，后期可能会拖延高新申报进程。因此，企业需要在申报前做好各项规划，确保研发费用归集完整，占比达到要求。
3. ‌组织管理制度不完善‌：在申报高企的过程中，许多原本应具有高新资格的企业并没有相对完善的研发组织和管理制度，这可能会使企业在不应丢分的地方丢分。
4. ‌成果转化难以体现‌：成果转化的形式是多样化的，比如销售合同、测试报告、知识产权、技术服务等。企业需要加强项目管理，并着重关注知识产权、研发立项和高新产品之间的关联性，以确保成果转化能够充分体现。
5. ‌数据前后不一致‌：在整理申报材料时，各报表数据不一致是普遍问题，如企业所得税年度纳税申报表、企业年度审计报告、专项审计报告等。企业需要特别注意涉及主营业务收入、主营业务成本、管理费用、研发支出、职工薪酬、利润总额等关键数据的数据一致性。
6. ‌临时抱佛脚‌：有些企业条件欠缺，没有提前进行筹划，临时准备申报材料，存在材料不真实的问题，这可能会为企业后续发展埋下隐患。

为了顺利申报高企，企业需要提前规划，确保各项条件都符合要求。同时，企业还应加强内部管理，完善研发组织和管理制度，提高成果转化的可信度和成功申报的机会。